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善用資料網格來加速醫療數位轉型

2023-01-05
分類 : 專欄
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1200 documents concept doctor use computer connection server data base patient technology treatment hospital documents conce

口述/孫培然‧彙整/CIO編輯室


孫培然
孫培然博士目前擔任私立醫療院所協會醫院資訊暨智慧醫療發展促進會會長,也任職於中國醫藥大學附設醫院資訊室副主任,正進行體系HIS再造工程,是一位勇於接受挑戰及洞燭先機採用新技術的領導者,亦曾在中山醫大附設醫院任職資訊室主任時,回收委外HIS系統,重新改造的成功案例。

想要透過資料網格(Data Mesh)來加速數位轉型,首先要注意的是數位轉型的資料和資料需求。第一個要點是資料的賦能,分析巨量資料來達成應用增值 AI 相關應用,並能進行資訊分發調度及管理稽核,打造出一個資料交換機制。

第二個要點是大量資料的查詢需求,讓大量使用者可以瀏覽或操作,以及高併發資料的查詢,讓這些需求可以透過分散式架構,快速做到讀寫分離或者分配等,並具備高擴展性,隨時可增加資料庫數量,不須建置複雜的資料庫叢集。

第三個要點是新舊系統資料要做到即時同步整合,又不能損及舊系統資料庫的效能,並且可以執行高速的跨系統資料關聯查詢,當資料源有異動時,也才能自動更新目的端資料庫。

最後一個重點是分散式架構的資料備份和跨容器的備援機制,跨叢集的資料同步,以及應用層的資料一致性。這些要點都是數位轉型的相關需求。

我們能不能把微服務架構的好處,應用到資料跟事件驅動,創建出一種資料網格呢?也就是說,我們既然已經將線上交易處理(Online transaction processing,OLTP)系統都微服務了,也要試著慢慢的將更為龐大的線上分析處理(Online analytical processing,OLAP)單體式的系統微服務化,或許就可以打通之前產生的瓶頸和問題。

內容目錄 隱藏
HIS 優化再造的工法
臨床研究數據中台
資料平台典範式改革正在發生

HIS 優化再造的工法

HIS 的優化再造,如果要做到無縫接軌,工程會非常浩大,就好像橫跨在火車鐵軌或是高速公路上蓋一座橋時,不能說在蓋橋時讓鐵路或高速公路全部停止行駛,而是要在可以行駛的時候,還可以繼續的去蓋橋。

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▲ 圖一 典範轉移:新舊HIS資料庫即時同步(點圖可放大)

要如何讓新舊 HIS 資料庫能夠做到即時同步?如圖一所示,可以透過 CDC(Change Data Capture)、事件驅動(Event driven )或是串流(Stream),把舊的 HIS 資料庫,透過 CDC 匯入到自助資料服務的平台,以 Low-code/No-code 來設定資料轉置的方法,產生不同新資料的管線(pipeline),透過 API 輸出跟新資料庫去同步,一旦資料進來了,就可以即時通知,讓新舊資料庫做到即時同步。重新改寫的 HIS 微服務再去存取新的資料,新的系統只會針對新的資料結構去做存儲,不會跟舊系統有任何掛勾。

所以 HIS 優化再造的工法,可以借鏡都市更新計畫工程,每一個舊系統的更新就好像要改建老舊社區時,應該是先把未來的新 HIS 資料結構架起來,然後透過「資料即產品」的概念,讓舊系統的資料可以即時同步,接到新的HIS架構之後,完成整個資料的同步行為。

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如此一來,如果資訊人力多的時候,就可以做到地下樓層跟地上樓層同時作業,如果資訊人力不足,就可以先針對比較有問題的先蓋。也就是說新舊系統的同步,如果可以透過資料網格做到即時同步,若是這樣 HIS 還需要做到一次到位的更換嗎?這是值得大家思考的方向。

一旦做到資料同步以後,就可以開始一個一個抽離錯綜複雜的單體程式,慢慢的去建構新的 HIS 系統的微服務功能,不斷地迭代做到循序漸進的轉移。如果沒有很大的資源,或是人力不足時,就可以用前述的方式慢慢的轉移舊系統,先針關鍵性或較有問題的系統進行汰舊換新。

臨床研究數據中台

很多醫院會把他們的 HIS 的資料庫 ETL(Extract-Transform-Load;擷取、轉換和載入)到大數據中心的資料倉儲,但對於各科臨床研究中心的資料庫,如中風、外傷、胸痛、腎臟等資料庫,卻會碰到很多問題,原因在於管理大數據中心的人員,往往缺乏各專科領域知識,也就是不懂各專科的需求,且各科臨床研究中心的醫學領域太深奧了。

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因此,若能透過資料網格的聯合計算治理概念,下放資料所有權給不同的科別團隊去做資料治理,透過自助資料服務基礎建設平台,進行自助資料服務以 Low-code/No-code 來設定資料轉置的方法,產生不同新資料的管線。提供視覺化平台工具,讓使用者不用撰寫程式直接拖拉過來設定資料管線,如資料轉移或是設定不同的架構量子,中間可以透過資料的輸入及輸出互相溝通,這些資料的輸入跟輸出,透過 API 的方式來做溝通交互,讓各科的資料也就可以互相分享。各科的資料來源,不管是 Oracle、Informix、SQL Server 或 MySQL 都不用擔心,除了前述的 CDC、Event driven及 Stream,還可以透過批次轉檔機制,將資料輸出到自助資料服務平台,提供不同的元件讓使用者自己去設定及轉換,再提供給各個數據中台如神內的中台、腎臟的中台。

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▲ 圖二 典範轉移:臨床研究數據中台(點圖可放大)

在資料聯合計算治理概念下,中台跟中台之間不但可以互相溝通,有這樣的概念以後,我們就可以支持醫療 AI 的發展需求。不管是醫院的資訊系統或是外部的開放資料系統,都可以透過這樣的方式產生不同領域的中台,再提供給 AI、機器學習(Machine Learning)、深度學習(Deep Learning)等作相關的研究分析。

資料平台典範式改革正在發生

傳統資料處理的工作方式,我稱之為 Data Mess,也就是資料雜亂,以集中方式開發,再提供給使用者,每一個人都可以針對資料去做處理,就會互相牽絆,導致工作互相耦合,可想而知就會進度緩慢,甚至交不出工作成果。

因此應該摒棄傳統的概念,改用現代化資料治理的思維 Data Mesh,也就是專業分工自動化,每一個科別都有自己設定資料轉置管線的架構量子,各自負責轉移資料來源提供的資料,如民國轉西元、字串轉數字等各自不同的領域,再快速的交付給使用者。

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▲ 圖三 資料網格(Data Mesh)典範的轉移。

每一個架構量子就是每一個 pipeline,只要在它的儀表板去設定今天要做什麼,它就可以乖乖的幫你做好。所以未來整個資料的典範轉移,或許我們已經不用從日常交易資料(Operation Data)透過 ETL 彙總到分析資料(Analytical Data),而是可能會變成將 Operation Data 及 Analytical Data 整合在一起,變成資料即產品的概念,就不再需要每個月或半年去將線上交易資料 ETL 到線上分析資料。

[ 推薦閱讀:孫培然專欄所有文章 ]

整個資料平台的演進,從最早 1980 年的資料倉儲(Data Warehouse),逐步演進到 2000 年的資料湖(Data Lake),以及 2010 年的雲端資料平台(Cloud Data Platform),再到 2020 年的資料湖倉(Data Lakehouse),在這數十年以來,耗費鉅資建設的資料平台,卻難以獲得預期收益。

所以從 2021 年開始,我們何不拋棄前面集中式的概念,改用微服務架構的概念,用分散式的架構思維取代單體式的集中式架構,把資料下放給使用者,做到「資料即產品」,引發一次典範式變革 — Data Mesh 。


(本文授權非營利轉載,請註明出處:CIO Taiwan)

標籤: HIS微服務數位轉型數據中台資料倉儲資料網格轉型醫療數位轉型醫療業
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